Estonija se, prema najnovijem Indeksu akademskih sloboda, nalazi na drugom mjestu u svijetu, iza Češke. Ovaj rezultat svrstava Estoniju u sam svjetski vrh u vrijeme kada se akademske slobode u velikom dijelu svijeta kreću u suprotnom smjeru. Izvješće pokazuje da su u posljednjih deset godina akademske slobode nazadovale u 50 zemalja, dok su se poboljšale u samo njih devet.

Indeks mjeri pet područja: slobodu istraživanja i poučavanja, slobodu akademske razmjene, slobodu akademskog i kulturnog izražavanja, institucionalnu autonomiju te integritet sveučilišta.

Opći trend negativan je u svih pet područja. Najveći pad između 2015. i 2025. zabilježen je u slobodi istraživanja i po